ביום 23.10.2006 פנה המוקד להגנת הפרט לשר הביטחון, בבקשה להתערבותו במדיניות הבלתי חוקית של הצבא בנוגע לאיחוד משפחות בין תושבי השטחים הכבושים לבני זוגם ובנוגע למתן רישיונות ביקור לבני הזוג. במכתב סוקר המוקד את ההסדרים שהיו נהוגים בעניין איחוד משפחות ורישיונות ביקור עד לשנת 2000, וכן את הקפאתם של הסדרים אלה לאחר פרוץ האינתיפאדה.
מדיניות זו של ישראל מנוגדת להוראות המשפט הישראלי, הבינלאומי ודיני הכיבוש, המחייבים לכבד את חיי המשפחה של התושבים. הקפאת תחום רישיונות הביקור ואיחוד המשפחות במשך למעלה משש שנים קורעת את מירקם החיים התקינים, שעל שמירתו מופקדת ישראל כמעצמה כובשת.
למדיניות זו אחת משתי מטרות: האחת – דמוגרפית-גזענית. בעוד ישראל ממשיכה להזרים אזרחים ישראלים להתנחלויות, היא דוחפת את התושבים המוגנים להגר. עליהם לבחור בין חיים בארצם לחיים עם משפחתם. מעבר לפסול הברור שבתכלית כזו, היא תמוהה נוכח הכוונה להתנתק מהשטחים.
השנייה – ענישה קולקטיבית. הרס המשפחות פוגע ישירות באוכלוסייה האזרחית, ומיועד לשבש את חייה ולזרוע סבל וייאוש. אזרחים מוחזקים כבני ערובה כאמצעי פסול ללחץ על הרשויות והארגונים הפלסטיניים.
המוקד פנה לשר הביטחון בבקשה לשנות את המדיניות הנוהגת כיום, כך שקשר זוגי יהווה קריטריון מספיק לאיחוד משפחות ורישיונות ביקור, בכפוף (אך ורק) להעדר סיכון ביטחוני ברמת ודאות גבוהה הצפויה מבן הזוג הזר.
לצפייה במכתבלצפייה בדו"ח המוקד ובצלם: משפחות בהקפאה - האיסור שמטילה ישראל על איחוד משפחות בשטחים מאז פרוץ האינתיפאדה השנייה 
